Nadgradnja ljubljanskega železniškega vozlišča, ki naj bi bila zaključena jeseni, je v polnem teku in s tem povzroča občasne, a znatne spremembe v potniškem prometu. Potniki se morajo tako prilagajati začasnim peronom, spremenjenim voznim redom in nadomestnim prevozom, kar je nazorno pokazala delna zapora postaje v začetku maja.
Vlaki proti Primorski, vključno z relacijami proti Kopru in Sežani, do nadaljnjega vozijo z začasnega perona ob Dunajski cesti, znanega kot tir 94. Za potovanja v smeri Štajerske, proti Zidanemu Mostu, Mariboru ali Dobovi, ter v smeri Dolenjske, pa so vlaki preusmerjeni na začasne perone 95 do 98, ki se nahajajo ob križišču Masarykove ceste in Njegoševe ulice. Slovenske železnice opozarjajo, da je od glavne postajne zgradbe do obeh lokacij začasnih peronov potrebnih približno deset minut hoje.
Med obsežnejšimi deli, kakršni so potekali med 1. in 3. majem, je na določenih odsekih organiziran tudi nadomestni avtobusni prevoz. To je veljalo za nekatere povezave na relacijah Ljubljana–Borovnica in Ljubljana–Ljubljana Zalog. Vsi nadomestni avtobusi potnike pobirajo in odlagajo na ploščadi ob tiru 1, v neposredni bližini glavne postaje.
Posebne prilagoditve veljajo tudi za tranzitne potnike. Med majsko zaporo je bil za potnike vlaka IC 503, ki so iz smeri Hodoša potovali proti Kopru, organiziran avtobusni prevoz od začasnih peronov na Masarykovi cesti do postaje Ljubljana Dolgi Most, kjer so prestopili nazaj na vlak.
Medtem ko so spremembe na primorski in štajerski progi najbolj očitne, proga proti Gorenjski (Jesenice, Beljak) večinoma obratuje nemoteno iz osrednjega dela postaje. Kljub temu lahko zaradi del na električnem omrežju na nekaterih odsekih, kot je Ljubljana–Ljubljana Vižmarje, namesto električnih začasno vozijo dizelske vlakovne garniture.
Na Slovenskih železnicah potnikom svetujejo, da pred vsakim potovanjem preverijo aktualne vozne rede in informacije o morebitnih spremembah ter si za pot vzamejo nekoliko več časa. Po zaključku del na osrednjem delu postaje, predvidoma jeseni, se bo obnova preselila v smeri proti Mostam oziroma Vodmatu.